Systém elektroforézy se skládá ze dvou hlavních součástí: napájecího zdroje a elektroforézní komory. Napájecí zdroj dodává energii. „Síla“ je v tomto případě elektřina. Elektřina, která pochází z napájecího zdroje, proudí jedním směrem z jednoho konce elektroforézní komory na druhý. Katoda a anoda komory jsou tím, co přitahuje opačně nabité částice.
Uvnitř elektroforézní komory je tác – přesněji licí tác. Licí miska se skládá z následujících částí: skleněná deska, která je zasunuta do dna licí misky. Gel je držen v odlévací misce. "Hřeben" vypadá jako jeho název. Hřeben je umístěn do štěrbin na straně odlévací misky. Do štěrbin se vkládá PŘED nalitím horkého roztaveného gelu. Po ztuhnutí gelu se hřeben vyjme. "Zuby" hřebenu zanechávají v gelu malé otvory, které nazýváme "studny". Jamky se vytvářejí, když horký, roztavený gel ztuhne kolem zubů hřebene. Hřeben se po vychladnutí gelu vytáhne, přičemž zůstanou jamky. Jamky poskytují místo pro umístění částic, které chcete testovat. Člověk musí být velmi opatrný, aby nenarušil gel při nakládání částic. Praskání nebo rozbití gelu pravděpodobně ovlivní vaše výsledky.